部分病例轮状病毒感染患儿存在肠道外损伤。可以表现为多系统受累，以呼吸系统最为多见，其次为肝酶异常、神经系统损害、心血管及循环系统损害。其他还包括尿路感染、全身性皮疹、血小板减少、合并EB病毒感染等。
肠道外损伤以一个脏器/系统损害多见，呼吸系统最容易受累，部分可表现为两个或三个脏器/系统损害，有些甚至可多达4个肠外脏器损害，以呼吸系统损害多见，高达88%，因此对轮状病毒腹泻患儿，在治疗原发病的同时要密切观察有无呼吸道，心脏，肝脏等脏器功能的改变以及重视多脏器功能的检查，以便及时采取相应救治措施，避免延误病情。
