（1）鼻病毒：包括100多种不同血清型，可致上感，支气管炎及中耳炎，冠状病毒也是上感的常见病原，但分离需用特殊方法。
（2）柯萨基及埃可病毒：此类病毒均甚微小，属于微小病毒，均可引起呼吸道症状。
（3）流感病毒：分甲、乙、丙三种血清型。甲型可因其抗原结构发生较剧烈的变异而导致大流行，估计每隔10～15年一次。乙型流行规模较小且局限，丙型一般只造成散发流行，病情也较轻，以上三型小儿呼吸道疾病中，主要引起上感，也可引起喉。气管、支气管炎、毛细支气管炎和肺炎。
（4）呼吸道全胞病毒：仅有一型，对婴幼儿呼吸道有很强的致病力，可引起小流行。1岁以内婴儿约75%左右可发生毛细支气管炎，30%左右可致喉、气管、支气管炎及肺炎等。2岁以后上述疾病渐少，5岁以后下呼吸道感染明显减少，仅表现为轻型上感。在上呼吸疲乏感染中以副流感病毒、呼吸道合胞病毒及冠状病毒较为常见。
（5）腺病毒：有30余种不同血清型。可致轻重不策的上呼吸道感染，如鼻咽炎、咽炎、咽结膜炎、滤泡性结膜炎，也可引起肺炎的流行。3、7型腺病毒可持续存在于上呼吸道腺体中，且可引起致死性肺炎。第8型腺病毒易在学龄儿童中引起流行性角膜结膜炎。第3、7、11型可致咽、结膜炎，1979～1983年夏季曾由于游泳，在北京引起3、7型腺病毒咽、结膜热流行。
（6）肺炎支原体：又名肺炎原浆菌或胸膜肺炎样微生物（简称PPLO），不但引起肺炎，也可引起上呼吸道感染、肺炎，多见于5～14岁小儿，仅为占上呼吸道感染的10%左右。侵入上呼吸道的继发性细菌感染大多属于β溶血性链球菌A组，肺炎球菌、嗜血流感杆菌及葡萄球菌，其中链球菌往往引起原发性咽炎。近年国外文献提到卡他布兰汉氏菌原名卡他奈瑟氏球菌，是鼻咽部常住菌菌群之一，有时在呼吸道可发展为致病菌感染，且有增多趋势。但次于肺炎球菌和流感杆菌感染。
